Sıfırdan işletim sistemi kurmaya kalkışmadan önce EFS (Encrypted File System) ile şifrelediğiniz dosyaları yedeklemelisiniz. Eğer böyle yapmazsanız yeni kurduğunuz sistemden şifrelenmiş dosyalara erişemezsiniz. Alternatif olarak dosyaların şifresini kaldırabilir ve harici bir diske kaydedebilirsiniz.
KİŞİSEL ANAHTARI KAYDETMEK: Internet Explorer'ı açın, Araçlar'dan İnternet Seçenekleri'ne girin. İçerik sekmesine geçiş
yapın ve Sertifikalar'a tıklayın. Kişisel sertifikalar listesinde kendi anahtarınızı işaretleyin ve "Ver" butonuna tıklayın. Dışarı aktarma sihirbazı açılığında "Kişisel anahtarı ver"i seçin, bir parola oluşturun ve kaydetme yerini belirtin. Bir USB bellek bu iş için çok uygundur. Daha sonra bu belleği güvenli bir yerde saklayın. Son olarak "Evet, kişisel anahtarı ver" butonuna basın.
ŞİFRELENMİŞ DOSYALARI YEDEKLEMEK: Her halükârda şifrelenmiş dosyaları bulabilmek için "cipher" komut satırı aracını kullanabilirsiniz. Başlat | Çalıştır yolunu takip ederek "cmd" komutunu verin. Vista ve Windows 7 altında başlat menüsündeki arama kutusuna cmd yazıp Enter'a basmanız yeterli. Komut satırı penceresi açıldıktan sonra şu komutu girin:cipher /u /n C: Komutu girdikten sonra Enter'a basın. Araç parametre olarak verilen sürücüyü (bizim örneğimizde C: sürücüsü) tarar ve sonrasında bulduğu tüm şifrelenmiş dosyaları gösterir. Çıkan sonuçlarda belirtilen konumları Windows Explorer'da bulun ve bu konumdaki dosyaları farklı bir disk bölümüne yedekleyin. Böyle bir durumda harici disk kullanmak en güvenli yöntem olacaktır.