Windows Disk Birleştirici'nin grafik arayüzü birden çok diskin görüntülenmesine izin vermiyor; en azından XP'de durum böyle. Ancak çoklu işlemler için "defrag.exe" adlı araca ilave komutlar eklenebileceği çoğu kişi tarafından bilinmiyor. Oysa ki ilave komutlar sayesinde birden çok sürücünün birleştirilmesi işini otomatik olarak gerçekleştirebilirsiniz. Eğer C, D ve E sürücüleriyle iş görüyorsanız
Notepad'e aşağıdaki ifadeleri girin:
@echo off
defrag.exe -f c:
defrag.exe -f d:
defrag.exe -f e:
Bu ifadeleri girdikten sonra dosyayı "defrag.cmd" olarak kaydedin. Eğer başka sürücü adları ya da daha çok sürücü kullanıyorsanız, kullanımınıza göre sürücü harflerini değiştirebilirsiniz. Böylelikle her sabit disk bölümünü otomatik olarak art arda birleştirebilecek ve bunu yapmak için yönetici haklarıyla giriş yaptığınız işlem kesintiye uğramayacak. Kullandığımız "-f" parametresi sayesinde diskinizdeki boş alan %10'un altına inmişse bile disk birleştirme işleminin gerçekleşmesine yarıyor. Ancak bu durumda birleştirme işlemi çok
uzun sürüyor. Önlem olarak ise yapabileceğiniz tek şey çok fazla yer kaplayan dosyaları silmek. Vista ve Windows 7'de birleştirme işlemini belirli bir takvim sırasıyla düzenleyebilirsiniz. Grafik arayüzden gelişi güzel sürücüleri seçebileceğiniz gibi, sırasıyla da işlemi devam ettirebilirsiniz. Bunun için sürücü başlığına sağ tıklayın ve bağlam menüsünden "Özellikler"i seçin. "Araçlar"a tıkladıktan sonra "Şimdi birleştir"i seçin. Windows 7 işletim sisteminde [Ctrl] tuşuna basılı tutarak dilediğiniz sürücünün harfine tıklayarak, belirlediğiniz sürücülerde disk birleştirme işlemini başlatmak gibi bir seçeneğiniz de var.