Microsoft Security Essentials'ın (MSE) arayüzü oldukça sade ve başarılı. Bilgisayarın durumu renklerle kolay anlaşılır şekilde aktarılıyor.MSE'nin sürüm kodları ile Microsoft'un iş kollarına sunduğu Forefront Client Security'nin sürümleri aynı.Arka planda çalışan eş zamanlı tarayıcı kullanırken hissedilmiyor bile. Tam bir sistem taramasında ise MSE işlemcinin %50'sini ve sistem belleğinin 150MB'lık kısmını kullanıyor.Eş zamanlı tarayıcı bir tehditle karşılaştığında bir uyarı penceresi açılıyor.Sorunla ilgili yapılacak eylemin kullanıcı tarafından belirlenmesi gerekiyor. Ama MSE kullanıcının karşısında en uygun eylemi gösteriyor.Rengimiz yeşil ve devam etmeye hazırız.Ayarlarda tehditlerde uygulanacak standart eylemleri belirleyebiliyorsunuz.Eş zamanlı tarayıcı yüklemeden sonra otomatik olarak çalışıyor. Bir sorun yaşayacağınızı sanmıyoruz ama isterseniz buradan ince ayar yapabilirsiniz.Taramaya girmesini istemediğiniz klasör ve diskleri buradan belirleyebilirsiniz.Buradan da taranmayacak dosya türlerini girebiliyorsunuz.Ayrıca gözlenmesini istemediğiniz uygulamaları da belirtebilirsiniz. Gelişmiş ayarlardan bir temizlik işlemi öncesinde geri dönüşüm noktası oluşturulmasını sağlayabilirsiniz.En son seçenekten şüpheli dosyaların SpyNet'e gönderilmesine izin verebilirsiniz.Kurulum sihirbazı size yardımcı oluyor.Sihirbaz kurulumdan önce orijinal bir Windows sahibi olup olmadığınızı denetliyor.Doğrulama aşamasından sonra sihirbaz sizi olası problemlere karşı uyarıyor.Daha sonra ise dosyalar sabit diskinize kopyalanıyor.Standart olarak sihirbaz ilk önce virüs tanımlarını güncelliyor, arından da kısa bir sistem taramasına başlıyor.İlerlediğinizde virüs tanımları güncelleniyor.Kısa bir sistem taramasından sonra ise MSE kullanıma hazır.